Les Men In Black ont toujours protégé la Terre de la vermine de l’univers. Dans cette nouvelle aventure, ils s’attaquent à la menace la plus importante qu’ils aient rencontrée à ce jour : une taupe au sein de leur organisation.
Transformé en assassin et tentant de récupérer son âme par un sanglant châtiment, Cain Burgess, un gangster anglais, s’échappe de prison afin de retourner dans son ancien quartier pour se venger des personnes qui l'ont trahi, un long chemin impitoyable...
Notre tueur professionnel est de retour et, cette fois, il va devoir affronter les meilleurs assassins du monde pour protéger le fils ingrat d'un parrain de la mafia, sauver la vie de son seul et unique ami et espérer renouer avec son père un peu détraqué.