Hors-la-loi, El Topo défie pour l'amour d'une femme les Quatre Maîtres du Désert. Les ayant vaincus, sa conscience s'élève jusqu'à ce que sa femme le trahisse. Sa nouvelle vie d'homme saint commence alors et El Topo s'engage dans la libération d'une communauté de parias.
A l'aube de sa vie, la peintre mexicaine Frida Kahlo se rappelle des événements marquants : ses premières toiles, son amitié avec Trotsky, sa relation avec le peintre Diego Rivera, ses amours, ses engagements politiques...
