Le gouvernement japonais met en place une équipe spéciale pour combattre les créatures géantes qui apparaissent soudainement dans le pays. Bientôt, l'équipe rencontre de manière inattendue un humanoïde géant argenté qui commence à apparaître chaque fois qu'un monstre de l'espace attaque...
Un athlète de renom rentre chez lui à contrecœur pour reprendre le rôle d'Ultraman après son père et protéger Tokyo des monstres géants. Il va devenir un héros légendaire.
Il y a 20 ans au Japon, les Ultra Kyodai (Kyodai = frères, ici Ultraman 1er du nom, Seven, Jack et Ace) ont combattu un monstre sanguinaire. Les Ultraman ont été capables de vaincre ce monstre après une longue bataille. Cependant afin de sceller l'animal, ils ont du abandonner tout leur...
Le premier lieutenant Shun'ichi Maki de la Japan Air Self-Defense Force est un prestigieux pilote de jet F-15 Eagle. Passionné de vol depuis son plus jeune âge, être pilote est son rêve ultime. Malheureusement, ses fonctions l'éloignent de sa femme, Yoko, qui finit toujours par être...