Dans une grande ville, à bord d'un ascenseur, Pikachu remarque un Pichu lui tirant la langue au loin, le Pokémon de Sacha fait de même. Une fois arrivés à destination, et alors qu'ils sortent tous leurs Pokémon, Sacha, Pierre et Ondine les laissent vaquer pendant qu'ils sont occupés à autre...
Une catastrophe de cristal s'attaque à Greenfield... Sacha, Pikachu et leurs amis doivent trouver une solution pour réparer les dégâts causés à cette ville jadis si élégante. Mais l'impensable se produit quand la mère de Sacha est enlevée par le puissant Entei, un Pokémon qui était...
