Tandis qu'aux Jeux Olympiques des athlètes battent une série de records dans plus de dix disciplines, Black Jack, le chirurgien de l’extrême, confronté à la mort d'une fillette qu'il n'a pu sauver, découvre ses organes internes incroyablement vieillis.
Une nouvelle rentrée se prépare au lycée Suzuran. Les boss de l’établissement, Genji et Tamao, ont été diplômés. Une bataille s’engage alors entre les nouveaux lycéens pour déterminer qui contrôlera l’établissement...
